Всё действие научно-фантастического фильма происходит в городе Сан-Франциско и направляется возле юного учёного, эксперименты с ДНК которого привели к возникновению высокоразвитого интеллекта у обезьян.
Автоботы Айронхайд, Сайдсвайп, Бамблби и Рэтчет под руководством Оптимуса Прайма снова сойдутся на поле боя с Десептиконами, которые очень сильно хотят отмщения после события второй части трилогии - «Месть падших».
В размашистых чащах между территорией Хайборейского королевства и морем показалась новая раса, сформированная из беглых бандитов, рабов и солдат-дезертиров.
Сестра с братом поневоле должны стать очень крутыми секретными шпионами, для того чтобы помешать, желающему подчинить себе мир, гнусному злодею негодяю, и выручить из беды родителей, ушедших на покой сверхсекретных агентов.